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昨天師姐請我吃飯,她的文章被接受了,《Cancer Letters》
一晃眼,跟著師姐做實驗4年了,再一晃眼,師姐的文章也被接受了,也要畢業了,X濕兄如愿以償地即將成為實驗室扛把子。
師姐說她應該是要回老家省會的一個三甲醫院工作,走上住院總→主治→副高→主任→……的路子,我還是不免為師姐的這種日子擔憂,師姐眼中卻滿是淡定和從容,也許一個真正的女漢子關鍵時刻是不會迷茫的。既然要當一名無所畏懼的女漢子,在三甲醫院闖出一片天地,那就不可避免地要繼續和科研打交道,寫標書、申基金、買試劑、做實驗、寫文章、參加各種大會混臉熟、招學生、上臨床,然后抽空回家里睡個覺,抽空送孩子上學。
說到申基金做實驗、發文章,是絕對要精打細算規劃的,拿多少錢,能發多高分數的SCI,這個要了然于胸的,就像過日子要知道柴米油鹽醬醋茶的價格一樣。
6分SCI文章成本
就拿師姐的這個檔次的期刊來說吧,《Cancer Letters》,IF為6,一線城市的三甲醫院不好進,但是到省會城市醫院不說敲鑼打鼓迎接你,至少會有那么一撮人羨慕嫉妒恨的,這個檔次的文章需要申請多少基金才夠呢?師姐的文章是關于ceRNA機制的,其實驗思路如下:
RNA-seq:師姐用的是測序,3對3,全轉錄本測序,成本6*7500=45K(幾年前的價格);
生信分析:外包給公司做,成本~15k;
Q-PCR確認差異表達:例如挑選了10個lncRNA,樣本量為50個,不做復孔,那么需要檢測500個數據,外加對照孔,成本~50k;
過表達、敲減lncRNA功能驗證:需要構建慢病毒過表達載體、敲減載體(or siRNA),成本~35k;
細胞表型變化(以腫瘤細胞為例):腫瘤細胞需要測增殖、轉移、成球能力,有需要的話還需要進一步檢測2~3種表型蛋白的mRNA、蛋白水平檢測,成本~40k;
LncRNA的胞內定位:FISH技術,分別檢測miRNA、lncRNA的胞內定位,成本~30k;
熒光素酶報告實驗:證明lncRNA和miRNA有結合,miRNA和靶基因mRNA的結合,~30k;
人員等雜費:至少得養1個博士、1個碩士吧,加上其他差旅費等雜費,60k要的(當然有些單位工資很低)。
論文發表成本:
期刊分為兩類,一是開源(OA)期刊,也就是收取發表費用的期刊,一般來說費用從1000-1500美元不等,也就是7000-10000人民幣(Cancer letters收了師姐3000刀),Plos One一年3萬多篇占所有SCI文章2%,很顯然是為了斂財而急劇擴張, Scientific Report也走在這條路上,Nature Communication是真貴,5200刀一篇。還有一種是非開源期刊,不收取任何發表費用。
師姐實驗失敗蠻多的,另外還有數據不夠好、條帶不清晰等各種不滿意的實驗結果,都需要重新做,考慮到這些成本,至少要再加1/3的錢。
師姐這篇6分文章的合計成本:約420k
6分左右的其他期刊按照要求不同,以及個人實驗水平,成本浮動范圍:250~480k
3分SCI文章成本
3分左右的SCI,例如Plos one,Cancer Medicine,Cancer Journal等,和6分相比可以缺少以下內容:
樣本檢測量:縮減到20個左右;
目標分子敲減和過表達只做其中之一;
胞內定位不做;
細胞表型實驗,例如轉移、成球能力等不做;只做一下特征蛋白的表達檢測。
其他雜費節省一點,大不了國際會議不參加了,給學生的補貼少一點嘛,應該給年輕人創造奮斗的條件。
考慮實驗重復和失敗重做,成本浮動范圍:150~250k
>10分SCI文章成本
10分以上文章這些實驗環節是不能少的(以lncRNA為例)
以lncRNA為例,由于其在DNA、RNA、蛋白質層面都參與調控,所以針對不同的分子機制設計不同的實驗方案,但這類實驗的成本變化浮動較大,80萬~幾百萬都有可能。
如果你的發現很有爆炸性,發現了一個不可描述、不得了的分子,那么驗證環節即便沒這么多,依然可以發CNS級別的,就像蜘蛛俠一樣,沒錢靠變異嘛,依然可以成為英雄。
但是如果發現的機制或者分子比較老套,那就只能砸錢做詳細的機制研究和論證了,這一點蝙蝠俠就是個例子。